蒙城縣城區現有污水處理廠(chǎng)兩座，其中蒙城縣清流污水處理廠(chǎng)位于老城區東側，建設規模3萬(wàn)噸/日，2005年開(kāi)工建設，2007年8月建成運行，2011年完成除磷脫氮技術(shù)改造，主要收集處理老城區約10.2平方公里范圍內的生活污水；蒙城縣污水處理二廠(chǎng)位于城南經(jīng)濟開(kāi)發(fā)區柳林路與莊子大道交叉口，一期工程2.5萬(wàn)噸/日規模于2012年4月開(kāi)工建設，2013年8月建成運行并通過(guò)環(huán)?？⒐を炇?，主體工藝采用卡魯塞爾2000型氧化溝+絮凝沉淀活性砂過(guò)濾工藝，剩余污泥采用板框式壓濾方式，主要收集處理鯤鵬路以南城南新區及道口工業(yè)園區范圍內的生活污水和部分工業(yè)污水。

截止到2014年底，蒙城縣城區污水管網(wǎng)總里程已達到200公里，管網(wǎng)已覆蓋整個(gè)城市規劃區，城市新區已全部實(shí)現雨污分流管網(wǎng)，老城區正在進(jìn)行雨污分流管網(wǎng)改造。蒙城縣老城區污水收集系統部分區域采用雨污合流管網(wǎng)，部分新修改造路段采用雨污分流制。

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